ডা. বোরহান উদ্দিন আহমেদ ঢাকা মেডিকেল কলেজ থেকে এমবিবিএস ডিগ্রী সম্পন্ন করেন।
তিনি যুক্তরাজ্যে ৬ বছর অতিবাহিত করেন এবং পিএলএবি পরীক্ষায় উত্তীর্ণ হন এবং ন্যাশনাল হেলথ সিস্টেমের অধীনে কাজ করেন। তিনি ইন্টারনাল মেডিসিন বিভাগের জুনিয়র ডাক্তার হিসেবে কাজ শুরু করেন এবং সাউথ ইয়র্কশায়ারে অবস্থিত রোথেরহাম জেনারেল হসপিটালে রেজিস্ট্রার হিসেবে দায়িত্ব গ্রহণ করেন। পরবর্তীতে তিনি যুক্তরাজ্যের রয়েল কলেজ অব ফিজিশিয়ানস হতে এমআরসিপি ডিগ্রী অর্জন করেন।
তিনি দেশে ফিরে বাংলাদেশ মেডিকেল কলেজ ও হসপিটালের ইন্টারনাল মেডিসিন বিভাগে এ্যাসিস্ট্যান্ট প্রফেসর হিসেবে ৫ বছর কর্মরত ছিলেন। এভাকেয়ার হসপিটাল ঢাকায় যোগদানের পূর্বে তিনি ইমার্জেন্সি মেডিসিন বিভাগে কনসালটেন্ট হিসেবে কিংডম অব সৌদি আরব কর্তৃক নিয়োগ প্রাপ্ত হয়ে ছিলেন এবং বেশ কিছু বছর সেখানেই কর্মরত ছিলেন।