ডা. খন্দকার মাহবুবর রহমান চট্টগ্রাম মেডিকেল কলেজ থেকে এমবিবিএস ডিগ্রী লাভ করেন। পরবতীর্তে, তিনি পিজি হসপিটালে ট্রেনিং শেষে বারডেম হসপিটালে মেডিসিন বিভাগে যোগদান করেন।
তিনি ২০০০ সালে নিউরোলজিতে এমডি ডিগ্রী অর্জন করেন। পরবতীর্তে, তিনি ময়মনসিংহ মেডিকেল কলেজে মেডিসিন বিভাগের রেজিষ্ট্রার, নিউরোলজি বিভাগের এসিস্ট্যান্ট ও এসোসিয়েট প্রফেসর হিসেবে কর্মরত ছিলেন।
২০১২ সালে এভারকেয়ার হসপিটাল ঢাকায় যোগদানের পূর্ব পর্যন্ত তিনি ময়মনসিংহ মেডিকেল কলেজের নিউরোলজি বিভাগের প্রধান ও ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ে স্নাতক ও স্নাতকোত্তর (নিউরোলজি) পরীক্ষার পরীক্ষক হিসেবে কাজ করেছেন।
তিনি ২০১৬ সাল থেকে এভারকেয়ার হসপিটাল ঢাকায় নিউরোলজি বিভাগের সিনিয়র কনসালটেন্ট হিসেবে কর্মরত আছেন।
চিকিৎসা বিষয়ক প্রখ্যাত বিভিন্ন জার্নালে তার ২৭টি প্রকাশণা প্রকাশিত হয়েছে।